Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB19A4D1S5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms