Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms