Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms