Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.187e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-205ENST00000467980 899 ntTSL 322.25■■□□□ 1.157e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-219ENST00000522266 480 ntTSL 219.64■□□□□ 0.737e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-213ENST00000488943 1262 ntTSL 518.09■□□□□ 0.497e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 517.95■□□□□ 0.467e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.417e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.357e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.247e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.27e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-218ENST00000519397 583 ntTSL 413.63□□□□□ -0.237e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.247e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.457e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.497e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.61e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SMIM1-202ENST00000452264 447 ntTSL 214.67□□□□□ -0.062e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 WWTR1-210ENST00000485244 560 ntTSL 47.42□□□□□ -1.227e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.287e-19■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.397e-19■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 MAMDC4-204ENST00000481327 380 ntTSL 318.51■□□□□ 0.551e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.27e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PLXND1-203ENST00000503166 626 ntTSL 310.8□□□□□ -0.684e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CLK2-204ENST00000471047 701 ntTSL 38.11□□□□□ -1.111e-31■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 MVD-211ENST00000565720 436 ntTSL 315.81■□□□□ 0.121e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 GATD1-209ENST00000528602 569 ntTSL 211.98□□□□□ -0.496e-9■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC16A3-207ENST00000578810 678 ntTSL 213.36□□□□□ -0.271e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.361e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.481e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 24.17□□□□□ -1.741e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 213.68□□□□□ -0.223e-27■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0895L-207ENST00000563918 798 ntTSL 215.05■□□□□ 02e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PABPC1L-216ENST00000490798 1384 ntTSL 316.23■□□□□ 0.191e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PABPC1L-211ENST00000476056 1214 ntTSL 510.22□□□□□ -0.771e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.312e-18■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PROC-209ENST00000464089 563 ntTSL 415.25■□□□□ 0.036e-18■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PROC-202ENST00000402125 779 ntTSL 215.13■□□□□ 0.016e-18■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SEC13-210ENST00000428626 567 ntTSL 313.51□□□□□ -0.253e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SEC13-213ENST00000445064 669 ntTSL 513.23□□□□□ -0.293e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.821e-11■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PDCD4-205ENST00000467574 735 ntTSL 322.07■■□□□ 1.121e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PDCD4-208ENST00000483670 774 ntTSL 521.84■■□□□ 1.091e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PYCR1-212ENST00000583564 377 ntTSL 317.12■□□□□ 0.334e-11■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA2-203ENST00000519640 565 ntTSL 517.1■□□□□ 0.331e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PDCD4-203ENST00000444997 819 ntTSL 314.74□□□□□ -0.051e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ADD2-206ENST00000415348 930 ntTSL 512.83□□□□□ -0.361e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ADD2-210ENST00000456320 997 ntTSL 512.83□□□□□ -0.361e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 MED10-202ENST00000503112 925 ntTSL 212.7□□□□□ -0.381e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PYCR1-215ENST00000585244 578 ntTSL 411.92□□□□□ -0.54e-11■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 410.66□□□□□ -0.72e-13■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CA11-203ENST00000596080 498 ntTSL 310.58□□□□□ -0.721e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 410.31□□□□□ -0.762e-13■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PDCD4-210ENST00000492932 813 ntTSL 39.85□□□□□ -0.831e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.021e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ADD2-203ENST00000403045 3745 ntTSL 28.49□□□□□ -1.051e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ADD2-205ENST00000413157 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.081e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ADD2-214ENST00000522886 874 ntTSL 58□□□□□ -1.131e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.211e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ACSM3-209ENST00000564701 756 ntTSL 37.22□□□□□ -1.252e-13■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SETD5-215ENST00000464410 593 ntTSL 45.32□□□□□ -1.561e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC37A3-221ENST00000487319 443 ntTSL 33.78□□□□□ -1.81e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ZMYND8-210ENST00000446894 341 ntTSL 21.31□□□□□ -2.24e-9■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 30.6□□□□□ -2.314e-9■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A5-202ENST00000416711 708 ntTSL 510.91□□□□□ -0.665e-9■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 313.42□□□□□ -0.263e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 DBN1-209ENST00000506117 477 ntTSL 412.79□□□□□ -0.368e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ATP5A1-217ENST00000591981 565 ntTSL 412.23□□□□□ -0.452e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 AGO3-207ENST00000634486 3599 ntTSL 511.89□□□□□ -0.511e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.631e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ATP5A1-214ENST00000590448 604 ntTSL 210.88□□□□□ -0.672e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 DBN1-211ENST00000514833 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.66□□□□□ -0.78e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PPRC1-204ENST00000462933 729 ntTSL 310.52□□□□□ -0.723e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CENPV-207ENST00000631687 671 nt10.4□□□□□ -0.741e-11■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 TGFBI-211ENST00000513497 588 ntTSL 210.24□□□□□ -0.775e-22■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ATP5A1-219ENST00000592989 553 ntTSL 58.82□□□□□ -12e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFP36L1-204ENST00000555997 3094 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-11■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ATP5A1-203ENST00000585650 520 ntTSL 55.94□□□□□ -1.462e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 RPN1-206ENST00000495462 566 ntTSL 35.47□□□□□ -1.534e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.61e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 P3H4-208ENST00000592026 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.92□□□□□ -0.51e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 HCFC1-204ENST00000461098 379 ntTSL 510.64□□□□□ -0.711e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 AKAP1-217ENST00000576295 614 ntTSL 312.4□□□□□ -0.421e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 MYO7A-211ENST00000620575 4016 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.827e-9■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 MYO7A-203ENST00000409893 4050 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.867e-9■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.946e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ERBB3-219ENST00000551242 2755 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.976e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ERBB3-217ENST00000551085 4382 ntTSL 28.69□□□□□ -1.026e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 RALGDS-209ENST00000471109 636 ntTSL 310.61□□□□□ -0.716e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 RALGDS-212ENST00000493067 217 ntTSL 27.86□□□□□ -1.156e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM189-204ENST00000371658 813 ntTSL 317.53■□□□□ 0.41e-12■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM189-205ENST00000453505 2028 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.051e-12■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-12■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 LMBR1L-217ENST00000551115 965 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.018e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 LMBR1L-209ENST00000548983 522 ntTSL 415.04■□□□□ -08e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 LMBR1L-221ENST00000551535 874 ntTSL 213.11□□□□□ -0.318e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-12■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-239ENST00000498115 796 ntTSL 515.59■□□□□ 0.097e-7■■□□□ 12.4
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 467.5 ms