Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CEP164Q9UPV0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CEP164Q9UPV0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms