Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms