Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYRIPQ8NFW9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms