Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SETD5-224ENST00000486465 886 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 SETD5-223ENST00000479538 427 ntTSL 39.4□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 PCNX4-205ENST00000483571 2347 ntTSL 55.83□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 RSL1D1-208ENST00000573251 894 ntTSL 37.34□□□□□ -1.239e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.289e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 RSL1D1-209ENST00000573618 710 ntTSL 57.01□□□□□ -1.299e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 RSL1D1-202ENST00000396503 1470 ntTSL 26.71□□□□□ -1.349e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 RSL1D1-201ENST00000355674 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.389e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 RSL1D1-207ENST00000573029 766 ntTSL 35.26□□□□□ -1.579e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-19■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 NCAPG2-208ENST00000474940 583 ntTSL 411.43□□□□□ -0.581e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 NCAPG2-209ENST00000475918 557 ntTSL 410.38□□□□□ -0.751e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 ATG4C-203ENST00000371120 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.912e-8■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 NCAPD3-206ENST00000527944 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.49□□□□□ -1.053e-13■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.261e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.341e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 NEMF-206ENST00000555411 573 ntTSL 45.97□□□□□ -1.453e-8■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.528e-8■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 FLVCR1-203ENST00000474693 590 ntTSL 35.34□□□□□ -1.565e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 RALGAPB-208ENST00000495949 636 ntTSL 35.18□□□□□ -1.581e-19■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 NUP58-210ENST00000477876 560 ntTSL 54.92□□□□□ -1.623e-13■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 WASHC4-205ENST00000548195 576 ntTSL 44.05□□□□□ -1.761e-19■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 WNK1-216ENST00000544559 226 ntTSL 1 (best)4.01□□□□□ -1.771e-19■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 KRR1-203ENST00000550023 855 ntTSL 24□□□□□ -1.778e-8■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 ALG6-207ENST00000603108 1811 ntTSL 53.53□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 WNK1-215ENST00000543065 201 ntTSL 1 (best)3.18□□□□□ -1.91e-19■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 WNK1-208ENST00000537603 553 ntTSL 33.05□□□□□ -1.921e-19■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 TFB1M-208ENST00000489874 563 ntTSL 32.46□□□□□ -2.021e-19■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.078e-8■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.171e-7■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 OGFOD1-205ENST00000565209 595 ntTSL 31□□□□□ -2.252e-13■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 BUB1B-206ENST00000558972 630 ntTSL 30.03□□□□□ -2.412e-7■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 CSDE1-206ENST00000483030 873 ntTSL 26.49□□□□□ -1.371e-9■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 BTF3L4-203ENST00000477828 892 ntTSL 514.69□□□□□ -0.066e-11■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 BTF3L4-201ENST00000313334 4703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.796e-11■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 BTF3L4-205ENST00000489308 794 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.846e-11■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 BTF3L4-204ENST00000484036 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.976e-11■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 BTF3L4-207ENST00000526132 567 ntTSL 47.83□□□□□ -1.166e-11■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.346e-11■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 PTK2-254ENST00000524040 475 ntTSL 216.15■□□□□ 0.183e-10■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.558e-10■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.318e-10■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 MARK3-207ENST00000553942 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 MARK3-223ENST00000561071 746 ntTSL 36.07□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 DUSP16-206ENST00000545864 554 ntTSL 42.43□□□□□ -2.026e-8■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 DDX18-202ENST00000415038 644 ntTSL 53.14□□□□□ -1.912e-9■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 SART3-213ENST00000550619 548 ntTSL 412.19□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 SART3-212ENST00000550322 582 ntTSL 410.49□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.313e-15■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A1-213ENST00000579139 568 ntTSL 49.95□□□□□ -0.828e-10■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 WDR43-206ENST00000466067 628 ntTSL 25.31□□□□□ -1.561e-7■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 OTUD4-206ENST00000505976 671 ntTSL 515□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A1-210ENST00000552197 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.826e-7■■■■■ 38.5
PRPF8Q6P2Q9 DAP3-222ENST00000496863 742 ntTSL 28.61□□□□□ -1.031e-12■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 DAP3-205ENST00000462002 716 ntTSL 38.24□□□□□ -1.091e-12■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 DAP3-213ENST00000471523 576 ntTSL 21.9□□□□□ -2.11e-12■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.88e-7■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.798e-7■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.68e-7■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 TSTA3-212ENST00000530474 823 ntTSL 510.59□□□□□ -0.718e-10■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.577e-9■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.157e-9■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 SNX13-204ENST00000444712 2018 ntTSL 512.22□□□□□ -0.457e-9■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 ERO1A-206ENST00000556039 1855 ntTSL 523.85■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 ERO1A-203ENST00000554019 2094 ntTSL 520.87■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2D-213ENST00000514328 1497 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.243e-8■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2D-203ENST00000379773 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.263e-8■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2D-208ENST00000508738 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.293e-8■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2D-214ENST00000515496 1533 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.653e-8■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 NAGK-215ENST00000479854 629 ntTSL 313.79□□□□□ -0.21e-21■■■■■ 38.4
PRPF8Q6P2Q9 NAGK-225ENST00000529236 463 ntTSL 513.66□□□□□ -0.221e-21■■■■■ 38.4
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 975 ms