Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)18.14■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 212.65□□□□□ -0.386e-7■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.266e-7■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TRIM29-219ENST00000532833 555 ntTSL 415.76■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TRIM29-212ENST00000529040 549 ntTSL 410.72□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TSPYL4-201ENST00000420283 4180 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.764e-8■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-24■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 ZNF652-203ENST00000508237 4543 ntTSL 212.79□□□□□ -0.361e-24■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.291e-24■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 SLC9A3R1-204ENST00000581356 519 ntTSL 311.89□□□□□ -0.518e-7■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.332e-9■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.3■□□□□ 0.524e-14■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.214e-14■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.464e-14■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.084e-18■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 IL17RE-204ENST00000434065 2541 ntTSL 221.63■■□□□ 1.054e-18■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.694e-18■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 IL17RE-202ENST00000383815 2808 ntTSL 218.86■□□□□ 0.614e-18■■■■■ 33.3
PCBP2Q15366 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.678e-7■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 MAP3K15-204ENST00000518578 4697 ntTSL 28.82□□□□□ -18e-7■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.441e-10■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.745e-10■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 DNM2-214ENST00000590787 4299 ntTSL 211.21□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 HM13-210ENST00000466766 358 ntTSL 212.73□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 HM13-223ENST00000496438 699 ntTSL 512.05□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 SHANK2-221ENST00000618363 434 ntTSL 310.93□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 33.2
PCBP2Q15366 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.641e-10■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.074e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.16e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 DDX10-202ENST00000524979 794 ntTSL 36.39□□□□□ -1.397e-8■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 DDX10-204ENST00000530116 435 ntTSL 36.08□□□□□ -1.447e-8■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 CD276-210ENST00000560928 2181 ntTSL 214.22□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 PPP2R2D-205ENST00000490777 1462 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.942e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 SEC24D-214ENST00000514561 3806 ntTSL 1 (best)4.57□□□□□ -1.682e-8■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 SRC-207ENST00000477066 3300 ntTSL 211.94□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 33.1
PCBP2Q15366 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 33
PCBP2Q15366 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 POGZ-207ENST00000441516 526 ntTSL 35.2□□□□□ -1.585e-10■■■■■ 33
PCBP2Q15366 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.875e-9■■■■■ 33
PCBP2Q15366 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.475e-9■■■■■ 33
PCBP2Q15366 TECR-225ENST00000601652 551 ntTSL 414□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 33
PCBP2Q15366 TECR-205ENST00000594807 569 ntTSL 411.18□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 33
PCBP2Q15366 TECR-219ENST00000600076 484 ntTSL 310.11□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 33
PCBP2Q15366 TECR-208ENST00000596164 245 ntTSL 37.72□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 33
PCBP2Q15366 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 410.47□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 EP400NL-213ENST00000613241 455 ntTSL 311.69□□□□□ -0.543e-34■■■■■ 33
PCBP2Q15366 SLC26A6-220ENST00000489483 5682 ntTSL 214.35□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 33
PCBP2Q15366 POLD1-212ENST00000600859 3474 ntTSL 213.67□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 LINC-PINT-202ENST00000423414 616 ntTSL 421.5■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 LINC-PINT-204ENST00000431189 803 ntTSL 319.56■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 LINC-PINT-203ENST00000429901 565 ntTSL 418.07■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 LINC-PINT-205ENST00000433079 1262 ntTSL 1 (best)17.92■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 LINC-PINT-206ENST00000435523 553 ntTSL 33.48□□□□□ -1.851e-7■■■■■ 33
PCBP2Q15366 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.785e-20■■■■■ 32.9
PCBP2Q15366 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 32.9
PCBP2Q15366 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 517.3■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 32.9
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