Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF3Q13114 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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