Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VBP1P61758 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VBP1P61758 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VBP1P61758 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VBP1P61758 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms