Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY3P57055 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms