Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms