Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-22■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.588e-7■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.313e-9■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 IAH1-210ENST00000492223 818 ntTSL 1 (best)20.8■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 YEATS4-205ENST00000552955 827 ntTSL 520.38■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 YEATS4-204ENST00000552949 428 ntTSL 217.82■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-18■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-18■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 YEATS4-203ENST00000549685 884 ntTSL 513.39□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 YEATS4-201ENST00000247843 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 BIRC2-204ENST00000527910 4073 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.422e-18■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 IAH1-214ENST00000496603 670 ntTSL 311.34□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 IAH1-203ENST00000481367 1137 ntTSL 210.99□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 IAH1-211ENST00000495050 2793 ntTSL 210.35□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 IAH1-205ENST00000482918 863 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 IAH1-201ENST00000351760 837 ntTSL 38.26□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 MMADHC-204ENST00000460311 324 ntTSL 26.91□□□□□ -1.31e-18■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.352e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.032e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TYMP-206ENST00000476284 1572 ntTSL 527.28■■□□□ 1.962e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.952e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.922e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TYMP-205ENST00000425169 1432 ntTSL 526.92■■□□□ 1.92e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TYMP-208ENST00000487577 1751 ntTSL 1 (best)26.58■■□□□ 1.852e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 THRA-205ENST00000577288 581 ntTSL 426.38■■□□□ 1.815e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 THRA-210ENST00000585047 574 ntTSL 425.34■■□□□ 1.655e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.645e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SBF2-AS1-205ENST00000527406 666 ntTSL 425.22■■□□□ 1.638e-9■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 THRA-208ENST00000578218 907 ntTSL 424.91■■□□□ 1.585e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.575e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.555e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 FAM117A-206ENST00000506156 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.37■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.353e-31■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 USP19-214ENST00000488993 1116 ntTSL 522.77■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 KIAA0232-205ENST00000508423 700 ntTSL 222.38■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.051e-11■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 GALNS-207ENST00000565364 1075 ntTSL 1 (best)21.23■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 ETV5-203ENST00000421809 554 ntTSL 221.12■□□□□ 0.971e-12■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 HOXC6-204ENST00000509328 358 ntTSL 320.98■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 USP19-201ENST00000306026 1905 ntTSL 220.96■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LRCH3-208ENST00000443727 611 ntTSL 420.44■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TRADD-204ENST00000566104 669 ntTSL 220.24■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.828e-9■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CEP350-210ENST00000491495 1059 ntTSL 519.97■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.85■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-217ENST00000607482 403 ntTSL 319.54■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.678e-9■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 USP19-215ENST00000491859 919 ntTSL 319.09■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 UBXN2B-205ENST00000523409 1225 ntTSL 518.58■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SLC9B2-210ENST00000512806 547 ntTSL 418.47■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 UBXN2B-204ENST00000522978 717 ntTSL 318.39■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 USP19-210ENST00000465902 617 ntTSL 318.38■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 FAM117A-210ENST00000514018 1128 ntTSL 518.21■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 BTG3-204ENST00000464058 531 ntTSL 218.02■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 ZNF75A-201ENST00000498240 2546 ntTSL 518.02■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 INPP5J-211ENST00000461241 2810 ntTSL 217.99■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 NUDT16P1-201ENST00000498923 1706 ntTSL 1 (best)17.71■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-214ENST00000606788 3056 ntTSL 217.3■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SYS1-205ENST00000453003 433 ntTSL 1 (best)16.83■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 931 ntTSL 1 (best)16.72■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 UBXN2B-202ENST00000520732 684 ntTSL 316.71■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PDPR-203ENST00000561920 2194 ntTSL 516.4■□□□□ 0.225e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 BTG3-203ENST00000457956 511 ntTSL 316.38■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 FAM117A-205ENST00000505159 739 ntTSL 316.27■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PMP22-205ENST00000471150 637 ntTSL 216.18■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.186e-15■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 33.6
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