RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306026.5

USP19-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 2

Gene USP19, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-201ENST00000306026 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.87■■■■■ 4.77
USP19-201ENST00000306026 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.23■■■■□ 3.87
USP19-201ENST00000306026 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
USP19-201ENST00000306026 ABCC9O60706 1549 aa37.41■■■■□ 3.58
USP19-201ENST00000306026 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.25■■■■□ 3.55
USP19-201ENST00000306026 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.11■■■■□ 3.53
USP19-201ENST00000306026 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.79■■■■□ 3.48
USP19-201ENST00000306026 NACADO15069 1562 aa36.66■■■■□ 3.46
USP19-201ENST00000306026 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.42■■■■□ 3.42
USP19-201ENST00000306026 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.42■■■■□ 3.42
USP19-201ENST00000306026 SCRIBQ14160 1630 aa36.05■■■■□ 3.36
USP19-201ENST00000306026 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.52■■■■□ 3.28
USP19-201ENST00000306026 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.25■■■■□ 3.23
USP19-201ENST00000306026 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.25■■■■□ 3.23
USP19-201ENST00000306026 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
USP19-201ENST00000306026 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.88■■■■□ 3.17
USP19-201ENST00000306026 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
USP19-201ENST00000306026 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
USP19-201ENST00000306026 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.64■■■■□ 3.14
USP19-201ENST00000306026 SMARCA4P51532 1647 aa34.53■■■■□ 3.12
USP19-201ENST00000306026 WIZO95785 1651 aa34.3■■■■□ 3.08
USP19-201ENST00000306026 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
USP19-201ENST00000306026 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.12■■■■□ 3.05
USP19-201ENST00000306026 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.08■■■■□ 3.05
USP19-201ENST00000306026 SMARCA2P51531 1590 aa34.06■■■■□ 3.04
USP19-201ENST00000306026 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
USP19-201ENST00000306026 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
USP19-201ENST00000306026 NCAPD3P42695 1498 aa33.85■■■■□ 3.01
USP19-201ENST00000306026 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.82■■■■□ 3
USP19-201ENST00000306026 HMGXB3Q12766 1538 aa33.75■■■□□ 2.99
USP19-201ENST00000306026 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.65■■■□□ 2.98
USP19-201ENST00000306026 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.26■■■□□ 2.92
USP19-201ENST00000306026 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.24■■■□□ 2.91
USP19-201ENST00000306026 CFTRP13569 1480 aa33.01■■■□□ 2.87
USP19-201ENST00000306026 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.98■■■□□ 2.87
USP19-201ENST00000306026 TRIM41Q8WV44 630 aa32.9■■■□□ 2.86
USP19-201ENST00000306026 ABCC8Q09428 1581 aa32.81■■■□□ 2.84
USP19-201ENST00000306026 NESP48681 1621 aa32.72■■■□□ 2.83
USP19-201ENST00000306026 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.72■■■□□ 2.83
USP19-201ENST00000306026 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.71■■■□□ 2.83
USP19-201ENST00000306026 PRDM2Q13029 1718 aa32.7■■■□□ 2.83
USP19-201ENST00000306026 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.6■■■□□ 2.81
USP19-201ENST00000306026 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.55■■■□□ 2.8
USP19-201ENST00000306026 SYNJ1O43426 1573 aa32.51■■■□□ 2.79
USP19-201ENST00000306026 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.43■■■□□ 2.78
USP19-201ENST00000306026 TOP2BQ02880 1626 aa32.42■■■□□ 2.78
USP19-201ENST00000306026 CUX1P39880 1505 aa32.41■■■□□ 2.78
USP19-201ENST00000306026 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.36■■■□□ 2.77
USP19-201ENST00000306026 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.27■■■□□ 2.76
USP19-201ENST00000306026 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
USP19-201ENST00000306026 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.22■■■□□ 2.75
USP19-201ENST00000306026 TOPBP1Q92547 1522 aa32.2■■■□□ 2.74
USP19-201ENST00000306026 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
USP19-201ENST00000306026 SOGA1O94964 1423 aa32.17■■■□□ 2.74
USP19-201ENST00000306026 ERCC6Q03468 1493 aa32.16■■■□□ 2.74
USP19-201ENST00000306026 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.12■■■□□ 2.73
USP19-201ENST00000306026 EEA1Q15075 1411 aa32.11■■■□□ 2.73
USP19-201ENST00000306026 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.11■■■□□ 2.73
USP19-201ENST00000306026 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.03■■■□□ 2.72
USP19-201ENST00000306026 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
USP19-201ENST00000306026 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.97■■■□□ 2.71
USP19-201ENST00000306026 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.96■■■□□ 2.71
USP19-201ENST00000306026 KIF27Q86VH2 1401 aa31.92■■■□□ 2.7
USP19-201ENST00000306026 WDR62O43379 1518 aa31.91■■■□□ 2.7
USP19-201ENST00000306026 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.91■■■□□ 2.7
USP19-201ENST00000306026 CUX2O14529 1486 aa31.89■■■□□ 2.7
USP19-201ENST00000306026 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
USP19-201ENST00000306026 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.84■■■□□ 2.69
USP19-201ENST00000306026 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.81■■■□□ 2.68
USP19-201ENST00000306026 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
USP19-201ENST00000306026 IFT140Q96RY7 1462 aa31.68■■■□□ 2.66
USP19-201ENST00000306026 WDR97A6NE52 1622 aa31.67■■■□□ 2.66
USP19-201ENST00000306026 IGF1RP08069 1367 aa31.65■■■□□ 2.66
USP19-201ENST00000306026 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
USP19-201ENST00000306026 KIF21BO75037 1637 aa31.63■■■□□ 2.65
USP19-201ENST00000306026 GOLGA3Q08378 1498 aa31.63■■■□□ 2.65
USP19-201ENST00000306026 PRXQ9BXM0 1461 aa31.59■■■□□ 2.65
USP19-201ENST00000306026 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.58■■■□□ 2.65
USP19-201ENST00000306026 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
USP19-201ENST00000306026 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.56■■■□□ 2.64
USP19-201ENST00000306026 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.53■■■□□ 2.64
USP19-201ENST00000306026 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.51■■■□□ 2.63
USP19-201ENST00000306026 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.5■■■□□ 2.63
USP19-201ENST00000306026 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.48■■■□□ 2.63
USP19-201ENST00000306026 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.48■■■□□ 2.63
USP19-201ENST00000306026 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
USP19-201ENST00000306026 CUL7Q14999 1698 aa31.39■■■□□ 2.62
USP19-201ENST00000306026 GRIN2BQ13224 1484 aa31.39■■■□□ 2.61
USP19-201ENST00000306026 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
USP19-201ENST00000306026 PBRM1Q86U86 1689 aa31.32■■■□□ 2.6
USP19-201ENST00000306026 CEP162Q5TB80 1403 aa31.27■■■□□ 2.6
USP19-201ENST00000306026 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.25■■■□□ 2.59
USP19-201ENST00000306026 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.19■■■□□ 2.58
USP19-201ENST00000306026 ADAMTS12P58397 1594 aa31.18■■■□□ 2.58
USP19-201ENST00000306026 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
USP19-201ENST00000306026 CLIP1P30622 1438 aa31.12■■■□□ 2.57
USP19-201ENST00000306026 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
USP19-201ENST00000306026 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
USP19-201ENST00000306026 SYNJ2O15056 1496 aa31.03■■■□□ 2.56
USP19-201ENST00000306026 GRIN2AQ12879 1464 aa30.98■■■□□ 2.55
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