RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487577.5

TYMP-208, Transcript of thymidine phosphorylase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TYMP, Length 1,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMP-208ENST00000487577 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.75■■■■■ 6.52
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TYMP-208ENST00000487577 ABCC9O60706 1549 aa45.98■■■■■ 4.95
TYMP-208ENST00000487577 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.58■■■■■ 4.89
TYMP-208ENST00000487577 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.5■■■■■ 4.87
TYMP-208ENST00000487577 NACADO15069 1562 aa45.27■■■■■ 4.84
TYMP-208ENST00000487577 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.89■■■■■ 4.78
TYMP-208ENST00000487577 SCRIBQ14160 1630 aa44.74■■■■■ 4.75
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TYMP-208ENST00000487577 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
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TYMP-208ENST00000487577 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
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TYMP-208ENST00000487577 WIZO95785 1651 aa42.75■■■■■ 4.43
TYMP-208ENST00000487577 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.3■■■■■ 4.36
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TYMP-208ENST00000487577 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.15■■■■■ 4.34
TYMP-208ENST00000487577 SMARCA2P51531 1590 aa42.14■■■■■ 4.34
TYMP-208ENST00000487577 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.98■■■■■ 4.31
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TYMP-208ENST00000487577 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.59■■■■■ 4.25
TYMP-208ENST00000487577 TRIM41Q8WV44 630 aa41.27■■■■■ 4.2
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TYMP-208ENST00000487577 CFTRP13569 1480 aa40.86■■■■■ 4.13
TYMP-208ENST00000487577 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.11
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TYMP-208ENST00000487577 PRDM2Q13029 1718 aa40.66■■■■■ 4.1
TYMP-208ENST00000487577 SYNJ1O43426 1573 aa40.56■■■■■ 4.08
TYMP-208ENST00000487577 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
TYMP-208ENST00000487577 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.5■■■■■ 4.07
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TYMP-208ENST00000487577 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.39■■■■■ 4.06
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TYMP-208ENST00000487577 NESP48681 1621 aa40.35■■■■■ 4.05
TYMP-208ENST00000487577 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.35■■■■■ 4.05
TYMP-208ENST00000487577 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.28■■■■■ 4.04
TYMP-208ENST00000487577 CUX1P39880 1505 aa40.28■■■■■ 4.04
TYMP-208ENST00000487577 SOGA1O94964 1423 aa40.25■■■■■ 4.03
TYMP-208ENST00000487577 EEA1Q15075 1411 aa40.18■■■■■ 4.02
TYMP-208ENST00000487577 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.09■■■■■ 4.01
TYMP-208ENST00000487577 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.07■■■■■ 4.01
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TYMP-208ENST00000487577 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
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TYMP-208ENST00000487577 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.54■■■■□ 3.92
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TYMP-208ENST00000487577 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.51■■■■□ 3.92
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TYMP-208ENST00000487577 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.43■■■■□ 3.9
TYMP-208ENST00000487577 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.38■■■■□ 3.89
TYMP-208ENST00000487577 IGF1RP08069 1367 aa39.34■■■■□ 3.89
TYMP-208ENST00000487577 WDR97A6NE52 1622 aa39.34■■■■□ 3.89
TYMP-208ENST00000487577 WDR62O43379 1518 aa39.32■■■■□ 3.88
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TYMP-208ENST00000487577 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.16■■■■□ 3.86
TYMP-208ENST00000487577 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
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TYMP-208ENST00000487577 IFT140Q96RY7 1462 aa39.07■■■■□ 3.84
TYMP-208ENST00000487577 CUL7Q14999 1698 aa39.06■■■■□ 3.84
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TYMP-208ENST00000487577 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
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TYMP-208ENST00000487577 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.66■■■■□ 3.78
TYMP-208ENST00000487577 ADAMTS12P58397 1594 aa38.66■■■■□ 3.78
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TYMP-208ENST00000487577 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.6■■■■□ 3.77
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TYMP-208ENST00000487577 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
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