RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476284.1

TYMP-206, Transcript of thymidine phosphorylase, humanhuman

TSL 5

Gene TYMP, Length 1,572 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMP-206ENST00000476284 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.9■■■■■ 7.66
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TYMP-206ENST00000476284 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.88■■■■■ 6.06
TYMP-206ENST00000476284 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.41■■■■■ 5.98
TYMP-206ENST00000476284 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.4■■■■■ 5.98
TYMP-206ENST00000476284 NACADO15069 1562 aa52.37■■■■■ 5.97
TYMP-206ENST00000476284 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.03■■■■■ 5.92
TYMP-206ENST00000476284 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.93■■■■■ 5.9
TYMP-206ENST00000476284 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.17■■■■■ 5.78
TYMP-206ENST00000476284 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.15■■■■■ 5.78
TYMP-206ENST00000476284 SCRIBQ14160 1630 aa51.04■■■■■ 5.76
TYMP-206ENST00000476284 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.79■■■■■ 5.72
TYMP-206ENST00000476284 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.14■■■■■ 5.62
TYMP-206ENST00000476284 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.92■■■■■ 5.58
TYMP-206ENST00000476284 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.47■■■■■ 5.51
TYMP-206ENST00000476284 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.24■■■■■ 5.47
TYMP-206ENST00000476284 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.07■■■■■ 5.45
TYMP-206ENST00000476284 SMARCA4P51532 1647 aa48.74■■■■■ 5.39
TYMP-206ENST00000476284 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.72■■■■■ 5.39
TYMP-206ENST00000476284 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.53■■■■■ 5.36
TYMP-206ENST00000476284 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.47■■■■■ 5.35
TYMP-206ENST00000476284 SMARCA2P51531 1590 aa48.36■■■■■ 5.33
TYMP-206ENST00000476284 NCAPD3P42695 1498 aa48.36■■■■■ 5.33
TYMP-206ENST00000476284 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.15■■■■■ 5.3
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TYMP-206ENST00000476284 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.08■■■■■ 5.29
TYMP-206ENST00000476284 HMGXB3Q12766 1538 aa48.07■■■■■ 5.29
TYMP-206ENST00000476284 WIZO95785 1651 aa48.03■■■■■ 5.28
TYMP-206ENST00000476284 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
TYMP-206ENST00000476284 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.32■■■■■ 5.17
TYMP-206ENST00000476284 NESP48681 1621 aa47.25■■■■■ 5.15
TYMP-206ENST00000476284 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.04■■■■■ 5.12
TYMP-206ENST00000476284 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.02■■■■■ 5.12
TYMP-206ENST00000476284 ERCC6Q03468 1493 aa47■■■■■ 5.11
TYMP-206ENST00000476284 CCDC88BA6NC98 1476 aa47■■■■■ 5.11
TYMP-206ENST00000476284 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.81■■■■■ 5.08
TYMP-206ENST00000476284 CFTRP13569 1480 aa46.75■■■■■ 5.07
TYMP-206ENST00000476284 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.59■■■■■ 5.05
TYMP-206ENST00000476284 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.5■■■■■ 5.03
TYMP-206ENST00000476284 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.4■■■■■ 5.02
TYMP-206ENST00000476284 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
TYMP-206ENST00000476284 PRDM2Q13029 1718 aa46.28■■■■■ 5
TYMP-206ENST00000476284 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.27■■■■■ 5
TYMP-206ENST00000476284 CUX2O14529 1486 aa46.26■■■■■ 5
TYMP-206ENST00000476284 WDR62O43379 1518 aa46.04■■■■■ 4.96
TYMP-206ENST00000476284 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
TYMP-206ENST00000476284 TOPBP1Q92547 1522 aa45.75■■■■■ 4.91
TYMP-206ENST00000476284 ABCC8Q09428 1581 aa45.72■■■■■ 4.91
TYMP-206ENST00000476284 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.67■■■■■ 4.9
TYMP-206ENST00000476284 CUX1P39880 1505 aa45.5■■■■■ 4.87
TYMP-206ENST00000476284 IFT140Q96RY7 1462 aa45.41■■■■■ 4.86
TYMP-206ENST00000476284 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
TYMP-206ENST00000476284 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.34■■■■■ 4.85
TYMP-206ENST00000476284 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.33■■■■■ 4.85
TYMP-206ENST00000476284 SOGA1O94964 1423 aa45.29■■■■■ 4.84
TYMP-206ENST00000476284 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.27■■■■■ 4.84
TYMP-206ENST00000476284 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.25■■■■■ 4.83
TYMP-206ENST00000476284 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
TYMP-206ENST00000476284 SYNJ1O43426 1573 aa45.17■■■■■ 4.82
TYMP-206ENST00000476284 TOP2BQ02880 1626 aa45.12■■■■■ 4.81
TYMP-206ENST00000476284 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.07■■■■■ 4.811e-6■■□□□ 14.5
TYMP-206ENST00000476284 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.07■■■■■ 4.81
TYMP-206ENST00000476284 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
TYMP-206ENST00000476284 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
TYMP-206ENST00000476284 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.85■■■■■ 4.77
TYMP-206ENST00000476284 WDR97A6NE52 1622 aa44.79■■■■■ 4.76
TYMP-206ENST00000476284 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.73■■■■■ 4.75
TYMP-206ENST00000476284 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.72■■■■■ 4.75
TYMP-206ENST00000476284 FBLN2P98095 1184 aa44.66■■■■■ 4.74
TYMP-206ENST00000476284 GRIN2BQ13224 1484 aa44.66■■■■■ 4.74
TYMP-206ENST00000476284 TRIM41Q8WV44 630 aa44.61■■■■■ 4.73
TYMP-206ENST00000476284 OSCARQ8IYS5 282 aa44.6■■■■■ 4.73
TYMP-206ENST00000476284 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.6■■■■■ 4.73
TYMP-206ENST00000476284 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.59■■■■■ 4.73
TYMP-206ENST00000476284 PBRM1Q86U86 1689 aa44.51■■■■■ 4.72
TYMP-206ENST00000476284 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
TYMP-206ENST00000476284 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
TYMP-206ENST00000476284 KIF27Q86VH2 1401 aa44.38■■■■■ 4.69
TYMP-206ENST00000476284 CHD1O14646 1710 aa44.37■■■■■ 4.69
TYMP-206ENST00000476284 SYNJ2O15056 1496 aa44.32■■■■■ 4.69
TYMP-206ENST00000476284 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.3■■■■■ 4.68
TYMP-206ENST00000476284 IGF1RP08069 1367 aa44.2■■■■■ 4.67
TYMP-206ENST00000476284 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.2■■■■■ 4.67
TYMP-206ENST00000476284 ADAMTS12P58397 1594 aa44.18■■■■■ 4.66
TYMP-206ENST00000476284 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.18■■■■■ 4.66
TYMP-206ENST00000476284 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.11■■■■■ 4.65
TYMP-206ENST00000476284 GRIN2AQ12879 1464 aa44.07■■■■■ 4.65
TYMP-206ENST00000476284 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.97■■■■■ 4.63
TYMP-206ENST00000476284 CUL7Q14999 1698 aa43.92■■■■■ 4.62
TYMP-206ENST00000476284 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.86■■■■■ 4.61
TYMP-206ENST00000476284 CEP170Q5SW79 1584 aa43.83■■■■■ 4.61
TYMP-206ENST00000476284 NUP160Q12769 1436 aa43.83■■■■■ 4.61
TYMP-206ENST00000476284 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
TYMP-206ENST00000476284 ARHGEF11O15085 1522 aa43.73■■■■■ 4.59
TYMP-206ENST00000476284 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.71■■■■■ 4.59
TYMP-206ENST00000476284 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.71■■■■■ 4.59
TYMP-206ENST00000476284 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.71■■■■■ 4.59
TYMP-206ENST00000476284 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.71■■■■■ 4.59
TYMP-206ENST00000476284 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.67■■■■■ 4.58
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