Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EBAG9O00559 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBAG9O00559 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms