Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TULP1O00294 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TULP1O00294 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TULP1O00294 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms