Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HECTD4Q9Y4D8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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