Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAB39Q9Y376 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms