Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms