Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP3S1Q92572 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP3S1Q92572 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms