Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00575Q6W349 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms