Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms