Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms