Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8Q15843 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8Q15843 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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