Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPSQ13938 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms