Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN12Q05209 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms