Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms