Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms