Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HBBP68871 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
HBBP68871 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HBBP68871 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HBBP68871 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
HBBP68871 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HBBP68871 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HBBP68871 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HBBP68871 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HBBP68871 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HBBP68871 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms