Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-1P43699 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms