Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRIP30626 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRIP30626 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRIP30626 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRIP30626 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRIP30626 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRIP30626 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRIP30626 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRIP30626 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRIP30626 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRIP30626 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRIP30626 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRIP30626 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRIP30626 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms