Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK2O60296 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms