Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMB4A4D0S4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMB4A4D0S4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms