Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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