Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms