Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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