Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NWD2Q9ULI1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NWD2Q9ULI1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms