Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKDREJQ9NTG1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDREJQ9NTG1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms