Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 UTP4-203ENST00000562237 2186 ntTSL 1 (best)21.05■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-216ENST00000545859 553 ntTSL 521.05■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-206ENST00000439983 615 ntTSL 420.93■□□□□ 0.942e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.949e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.912e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.898e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NUP50-AS1-202ENST00000432502 596 ntTSL 220.62■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FBXO3-212ENST00000533103 570 ntTSL 420.6■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NDUFAF3-205ENST00000480392 769 ntTSL 220.59■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-213ENST00000580484 686 ntTSL 320.52■□□□□ 0.882e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.872e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JOSD1-202ENST00000412832 529 ntTSL 520.4■□□□□ 0.862e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HRAS-207ENST00000468682 749 ntTSL 320.35■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ABHD12-206ENST00000471287 805 ntTSL 320.33■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.828e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FANCA-212ENST00000563513 571 ntTSL 420.13■□□□□ 0.819e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-202ENST00000435059 910 ntTSL 220.12■□□□□ 0.812e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MRPL55-230ENST00000489430 847 ntTSL 520.11■□□□□ 0.812e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TAF6L-204ENST00000526261 419 ntTSL 520.04■□□□□ 0.82e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-210ENST00000568416 520 ntTSL 220.02■□□□□ 0.82e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC12A5-AS1-201ENST00000419897 491 ntTSL 319.99■□□□□ 0.792e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.772e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDKN1A-206ENST00000462537 553 ntTSL 319.8■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RFTN1-202ENST00000431547 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.72■□□□□ 0.752e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HRAS-211ENST00000493230 1114 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.742e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-219ENST00000515850 862 ntTSL 519.61■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ALKBH3-210ENST00000532962 1371 ntTSL 1 (best)19.6■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TAF6L-202ENST00000524976 1061 ntTSL 1 (best)19.51■□□□□ 0.712e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TAF6L-205ENST00000529509 528 ntTSL 419.51■□□□□ 0.712e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C12orf43-205ENST00000535367 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.51■□□□□ 0.712e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CACNB1-205ENST00000536613 575 ntTSL 419.5■□□□□ 0.712e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-214ENST00000509781 806 ntTSL 219.4■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C12orf43-203ENST00000502891 1702 ntTSL 319.39■□□□□ 0.692e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.692e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POU2F2-211ENST00000532176 589 ntTSL 319.29■□□□□ 0.682e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MSANTD4-205ENST00000534458 612 ntTSL 419.25■□□□□ 0.672e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.662e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PLXNB2-205ENST00000432455 1620 ntTSL 519.14■□□□□ 0.661e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RNF34-209ENST00000556562 542 ntTSL 219.08■□□□□ 0.649e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CORO6-208ENST00000577909 492 ntTSL 319.05■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDKN1A-205ENST00000459970 604 ntTSL 519.01■□□□□ 0.632e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TAF6L-203ENST00000525405 594 ntTSL 518.98■□□□□ 0.632e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TAF6L-207ENST00000532915 990 ntTSL 218.98■□□□□ 0.632e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYP26C1-202ENST00000624358 4208 ntTSL 218.91■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MSANTD4-203ENST00000530108 780 ntTSL 218.86■□□□□ 0.612e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C12orf43-209ENST00000546272 1339 ntTSL 218.76■□□□□ 0.592e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POR-219ENST00000471238 600 ntTSL 318.76■□□□□ 0.592e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-204ENST00000537201 572 ntTSL 418.63■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BACH2-203ENST00000406998 780 ntTSL 218.62■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-216ENST00000511763 581 ntTSL 318.62■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BACH2-204ENST00000453877 868 ntTSL 518.62■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 APC2-204ENST00000587149 555 ntTSL 518.6■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-207ENST00000518692 726 ntTSL 518.58■□□□□ 0.562e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-226ENST00000584861 579 ntTSL 218.57■□□□□ 0.562e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MAP3K6-204ENST00000472410 2530 ntTSL 1 (best)18.57■□□□□ 0.562e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CMTM6-203ENST00000495177 670 ntTSL 218.54■□□□□ 0.562e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.562e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.562e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-211ENST00000542722 1423 ntTSL 518.5■□□□□ 0.552e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.552e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM39B-205ENST00000468135 1834 ntTSL 518.47■□□□□ 0.552e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.552e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.552e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.552e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FAM118B-203ENST00000525728 688 ntTSL 318.41■□□□□ 0.542e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AL928654.2-202ENST00000504332 1447 ntTSL 218.39■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM39B-203ENST00000441402 1538 ntTSL 1 (best)18.27■□□□□ 0.512e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.512e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C20orf204-202ENST00000431158 2954 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-201ENST00000293208 1272 ntTSL 518.19■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-221ENST00000496878 2269 ntTSL 218.17■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RALGPS2-209ENST00000495034 1970 ntTSL 218.16■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 UTP4-209ENST00000567235 586 ntTSL 518.11■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 APC2-208ENST00000593146 2897 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDKN1A-207ENST00000478800 616 ntTSL 218.1■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 223.6
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