Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms