Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NHSL1Q5SYE7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms