Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF212Q495C1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms