Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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