Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3GAP1Q15042 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3GAP1Q15042 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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