Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GRIN2BQ13224 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
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