Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms