Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms